Mushroom Hero bercerita tentang seorang pemuda bernama Rian yang menemukan kekuatan luar biasa setelah memakan jamur misterius di sebuah hutan terlarang. Dengan kemampuan barunya, ia harus melindungi desanya dari ancaman gelap yang ingin menguasai alam dan menghancurkan kedamaian yang selama ini terjaga. Dalam perjalanannya, Rian bertemu dengan berbagai karakter unik yang membantunya memahami arti kekuatan sebenarnya. Ia belajar bahwa keberanian dan solidaritas lebih penting dari sekadar kemampuan fisik, serta bahwa menjaga keseimbangan alam adalah kunci untuk masa depan yang lebih baik.